Originalmente era una iglesia bizantina. Es la iglesia más grande de Estambul. En 1641, finalmente se convirtió en la iglesia central (catedral) del Patriarcado armenio de Estambul. Se quemó hasta las cenizas en 1645 y fue reconstruido el mismo año, durante el reinado del patriarca Tavit Areveltzi y con los esfuerzos del sacerdote Boghos de Divrik. El incendio de 1718 destruyó la iglesia y todo el patriarcado. Un año más tarde, la iglesia fue reconstruida con los esfuerzos del Patriarca de Jerusalén Krikor Şığtayagir y el Patriarca de Estambul Hovhannes Golod, y por los arquitectos Hacı Seğpos, Hacı Melidon Araboğlu y Sarkis Kalfa. En 1762 un incendio volvió a dañar el edificio, pero el patriarca Hagop Nalyan lo renovó rápidamente. Más tarde, el Patriarca Zakarya rodeó la iglesia con un muro de piedra y tomó precauciones con una piscina y una bomba para evitar que la iglesia fuera afectada por el incendio. La iglesia fue reparada en 1819 durante el reinado del Patriarca Boghos de Edirne, bajo la supervisión de Harutyun Amira Bezciyan (Kazaz Artin).

La iglesia y el patriarcado fueron completamente destruidos por un incendio en 1826. Harutyun Amira Bezciyan, Sultán II. Por decreto de Mahmud, la iglesia se construyó en piedra según planos de los arquitectos Kirkor Amira Balyan y Garabet Devletyan, y se abrió al culto en 1828. 

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