Camiye ismini veren Şeyh Bedrettin, Bursa Emir Sultan Dergahı’nın 3. şeyhi Bedrettin Halife’dir. Camiyi muhtemelen 1420-1440 arasında bir tarihte yaptırmıştır. Şu anki cami ise eski caminin yıkılıp yeniden yapılmasıyla 1954 yılında inşa edilmiştir. Bu inşa sırasında caminin haziresi talan edilmiştir.