Edo Dönemi’ndeki Hristiyanlığa olan yasağın kaldırılmasından sonra Gotō adalarına inşa edilen ilk kilisedir. 1908 yılında tamamlanmıştır. Kilise 1977 yılında müzeye çevrilmiştir. 2007 yılında UNESCO Dünya Mirası Geçici Listesi’ne alınan Kilise, müze olması sebebiyle özellikleri tekrar gözden geçirilmiş ve listeden çıkarılmıştır.