Die Hasan-Ağa-Moschee wurde laut den Aufzeichnungen der Waqf im zweiten Viertel des 16. Jahrhunderts von Hacı Hasan Ağa, dem Oberportier von İskender Pascha, errichten lassen. Das Gebäude befindet sich im Stadtteil Çarşı, an der Kreuzung der Mahmut-Goloğlu-Straße und der Sakız-Meydanı-Straße. Aufgrund der Hanglage des Grundstücks weist es eine gestufte Anordnung auf, und im unteren Bereich befinden sich Geschäfte. Dass der Name des Viertels in den Katasteraufnahmen von 1553 und 1583 als „Hacı Hasan“ erscheint, bestätigt die Angaben in den Stiftungsunterlagen.
Die Moschee hat einen fünfeckigen Grundriss, ist aus grob behauenem Stein erbaut und verfügt über ein Satteldach, das mit geriffelten Ziegeln gedeckt ist. Der Zugang zum Bauwerk erfolgt über eine Steintreppe an der Südostfassade. Da die Moschee kein Minarett besitzt, wurde der Gebetsruf von einem Balkon aus verkündet, der vom Mahfil-Stockwerk aus zugänglich ist. Die Fenster an der Südfassade sind mit Flachbögen versehen, die übrigen Fenster sind rechteckig. Alle Fenster haben Steinrahmen, sind mit Eisengittern versehen und mit Holzflügeln ausgestattet. Der Zugang zum Gebetsraum erfolgt durch eine eiserne Tür mit Rundbogen und Steinrahmen. Rechts vom Eingang führt eine Holztreppe zur Frauenempore.
Die Decken und Fußböden des Gebetsraums bestehen aus Holz. Die Wände sind bis zur Brüstungshöhe mit Holzvertäfelungen verkleidet. Der mit weißer Ölfarbe gestrichene steinerne Mihrab weist Spuren des Barockstils auf. Der Mihrab mit runder Nische, gekerbter Kuppel und Säulen ist mit geschwungenen Blättern, Rosettenblumen und Fächer-Motiven verziert. Die hölzerne Minbar rechts vom Mihrab wurde dem Gebäude vermutlich bei der letzten Restaurierung hinzugefügt. Da die Hasan-Ağa-Moschee vor allem von Handwerkern zum Gebet genutzt wurde, verfügt sie über keine Kanzel. Die Moschee wurde in den Jahren 1973 und 2006 restauriert und ist so bis heute erhalten geblieben.
Die Bauinschrift des Gebäudes ist nicht erhalten geblieben. Allerdings befindet sich auf der Kanzel eine Tafel, auf der das Datum der Restaurierung vermerkt ist:
Der Besitzer der Kanzel, der am Tag des Jüngsten Gerichts für das Volk Fürsprache einlegen wird: Muhammad 1302 H/1885 M.