Hasan Ağa Camii, vakıf kayıtlarına göre 16. yüzyılın ikinci çeyreğinde, İskender Paşa’nın kapıcıbaşı olan Hacı Hasan Ağa tarafından yaptırılmıştır. Çarşı Mahallesi’nde, Mahmut Goloğlu Caddesi ile Sakız Meydanı Sokak’ın birleşiminde yer alan yapı, kurulduğu alanın eğimi sebebiyle fevkani bir düzenleme gösterir ve alt kısmında dükkânlar bulunur. 1553 ve 1583 tarihli tahrirlerde mahallenin adının Hacı Hasan olarak geçmesi, vakıf kayıtlarındaki bilgiyi teyit etmektedir.
Cami beşgen planlı, kaba yonu taş malzemeli ve kırma çatılı olup çatısı oluklu kiremitle kaplıdır. Yapıya güneydoğu cephesinden taş merdivenlerle çıkılmaktadır. Minaresi bulunmayan camide ezan, mahfil katından açılan bir balkondan okunmaktaydı. Güney cephesindeki pencereler basık kemerli, diğer pencereler ise dikdörtgen formludur. Tüm pencereler taş söveli, demir parmaklıklı ve ahşap kanatlıdır. Harime giriş, yuvarlak kemerli ve taş söveli demir bir kapıdan sağlanır. Girişin sağından ahşap merdivenlerle kadınlar mahfiline çıkılmaktadır.
Harimin tavan ve döşemeleri ahşaptır. Duvarlar parapet seviyesine kadar ahşap lambri ile kaplanmıştır. Beyaz yağlı boya ile boyanan taş mihrapta Barok üslubun izleri mevcuttur. Yuvarlak nişli, dilimli kubbeli ve sütunceli mihrapta kıvrık yapraklar, rozet çiçekler ve yelpaze motifleri tezyin edilmiştir. Mihrabın sağında yer alan ahşap minber ise muhtemelen son onarımda yapıya ilave edilmiştir. Daha çok esnafların namaz kıldığı bir yapı olan Hasan Ağa Camii’nde vaaz kürsüsü bulunmamaktadır. Cami 1973 ve 2006 yıllarında onarım görerek günümüze ulaşmıştır.
Yapının inşa kitabesi günümüze ulaşamamıştır. Buna karşın, minber üzerinde onarım tarihinin yazılı olduğu bir levha yer almaktadır:
Mahşerde halka şefaat edecek minberin sahibi Muhammed 1302 H/1885 M.