Der Bau der Medrese, die heute als Museum für türkisch-islamische Kunst dient, wurde 1414 von Çelebi Sultan Mehmet begonnen; zwar konnte sie aufgrund des Todes des Sultans im Jahr 1421 nicht wie geplant fertiggestellt werden, wurde jedoch 1424 eröffnet. Eine Zeit lang diente sie als Zweigstelle des „Müze-i Hümayun“ in Bursa. Sie ist auch als Sultaniye-Medrese bekannt.
Im Jahr 2020 wurden die Restaurierungsarbeiten abgeschlossen und das Gebäude wiedereröffnet.
