1998’de Gazze Araştırma Projesi’nin bir parçası olarak araştırıldı, ancak henüz kazılmadı. Arkeologlar, Orta Tunç Çağı’ndan Osmanlı dönemine kadar uzanan binalardan ve çanak çömleklerden kerpiçler keşfettiler. Ali Muntar Höyüğü’nün, Gazze Höyüğü’ndeki Tunç Çağı yerleşimiyle aynı zamanda iskan edilmiş olması muhtemeldir; arkeologlar Joanna Clarke ve Louise Steel, yerleşimin Muntar Höyüğü’nden Gazze Höyüğü’ne kaymış olabileceğini öne sürüyor. UNESCO, 2023’te başlayan İsrail işgali sonucu Ali Muntar Höyüğü de dahil olmak üzere 100’den fazla miras alanının zarar gördüğünü doğruladı.