Bağdad’ın aynı adla anılan semtindeki Musa Kâzım ile torunu Muhammed Cevad’ın Abbasi halifeleri İle Selçuklu vezirlerinin yaptırdığı türbe ve camii, Şah İsmail tarafından yıktırılarak 1515’te iki kubbeli bir türbe formunda yeniden yaptırılmıştır. 1570’te Sultan 2. Selim türbenin bitişiğine büyük bir cami ile kuzeybatısına bir minare ilave ettirmiş, 1796’da Kaçar Emirî Şah Ağa Muhammed kubbeleri altınla kaplatmıştır. 1880’de Refik Selim Paşa; 1882’de Osmanlı Hükûmetince görevlendirilen İranlı usta Ferhat Mirza; 1904’te Sultan II. Abdülhamid; 1977-1978 ve 1982 yıllarında Irak Vakıflar Bakanlığınca tamir ettirilmiştir. Minare kaidesindeki 2. Selim’e ait (1570) tarihli. Türkçe kitabe, Fuzulî’nin oğlu Fuzulî tarafından yazılmıştır.

Külliye, ortada cami ve türbe ile geniş bir avlunun etrafına sıralanmış medrese, imaret, imam-şeyh-hâdim odaları ve kütüphanelerin yer aldığı iki katlı revaklı hücrelerden oluşmaktadır. Türbe revaklarının dışında köşelerde dört büyük; türbe duvar köşelerinde sembolik dört küçük minare yer almaktadır. Minarelerin üst kısımları İran işgali sırasında İran üslûbunda örülerek altınla kaplanmıştır.