Yapının tarihini belirten herhangi bir kitabe yoktur; ancak yapının Çorum Kalesi içinde yer alması ve günümüzde dahi “Alaaddin Camii”, “Alaaddin Mescidi” olarak anılması yapının XIII. yüzyılın ortalarına doğru Anadolu Selçuklu Sultanlarından, Sultan I.Alaaddin Keykubat (1220-1237) tarafından yaptırıldığını
düşündürmektedir. Eser, mescit olarak yapılmışken daha sonra camiye çevrilmiştir. 1577 yılında cami, kale ile birlikte Kanuni Sultan Süleyman tarafından onarılmıştır