Beldenin güneybatısında bulunmaktadır. Doğal kaya kitlesinin içi oyularak şekillendirilmiş kilise yapısıdır. İç içe iki mekandan oluşmakta olan kilise doğuya bakan kaya bir yamaca oyularak oluşturulmuştur. Ön mekan kuzey güney doğrultusunda dikdörtgen planlı yaklaşık 4×10 m ebatlarında, üzeri tonoz şeklinde oyulmuştur. Kuzey kısmı daireseldir ve bu bölümde iki haç motifi bulunmaktadır. Batısında ise daha küçük bir oda daha bulunmaktadır. Bu iç oda yaklaşık 3×3 m ebatlarında üzeri çapraz tonoz şeklinde oyulmuştur. Ön bölümün güney tarafında, zeminde tahıl küpü şeklinde bir oyuk bulunmaktadır. Ayrıca duvarlarda çok sayıda irili ufaklı nişler oluşturulmuştur. Ana mekanın dışında, girişinin üzerinde, önünde saçak olabileceğini düşündüren ahşap hatıl boşlukları görülmüştür. Kilisenin 15 m kuzeyinde yine aynı kaya yamacına oyulmuş bir mekan daha bulunmaktadır. Yaklaşık 3×3 m ebatlarında, kare planlı, üstü konik bir şekilde baca gibi oyulmuş ve dışarı açılmaktadır. Mekanın bu şekli, ortasında ateş yakılarak yemek pişirilen bir yer olabileceği izlenimi vermektedir.

[1] Kaynarca Kaya Kilisesi | Kırklareli Kültür Varlıkları Envanteri (kirklarelienvanteri.gov.tr)

[2] Kaynarca, Kırklareli | https://www.enormousfish.co.uk/?p=10314