16. yüzyılda Mısırlı bir tüccar olan pamukçu Mustafa Efendi, Mısırlı bir hayırsever kadının hayratı olarak bugünkü Merkez Camii’nin bulunduğu yere bir cami yaptırmıştır. Ahşap olarak inşa edilen cami bir yangın sonucu büyük ölçüde tahrip olmuş, şu an mevcut bulunan caminin alt katını oluşturan mihrap ve son cemaat yeri günümüze ulaşmıştır. Günümüzdeki cami 1908 yılında, dere taşkınları sonucu alçakta kalan cami duvarları yükseltilerek ve genişletilerek yapılmıştır.