Yapım tarihi kesin olarak bilinememekle beraber 15. yüzyılın ikinci yarısında inşâ edildiği konusunda kaynaklar birleşmektedir. Fener kubbeli camiler türündendir. İsmini bahçesinde bulunan asırlık çınardan aldığı sanılmaktadır.

Yerel tarihçi Mehmet Göktekin’e (1900-1977) göre, bu caminin kurucusu Sungur Paşa, Amasyalı Saadettin Bey’in oğludur. Sultan I. Murat’ın sancaktarlığını yapan Sungur Paşa 1415 yılında bu cami ve medreseyi yaptırmıştır. Caminin 19. yüzyıl başlarında çökme tehlikesi gösteren kubbesi, 1830 yılında Yenişehir Voyvodası (Yöneticisi-Valisi) Ali Bey tarafından aslına uygun olarak onarılmıştır. Osmanlı dönemi yıllıklarında on sınıftan oluştuğundan bahsedilen medrese 1922 yılında yıkılmıştır.