Eski Misis Camii, Hicri 1070 (Miladi 1659/1660) tarihinde inşa edilmiştir. Yapıya ait inşa kitabesi bulunmamasına rağmen, Vakıflar Genel Müdürlüğü arşivindeki bir belgede caminin inşa tarihi Hicri 1070 olarak kayıtlıdır. Bu tarih, Havraniye Kervansarayı’nın 1659 yılında Sultan V. Mehmet tarafından yeniden inşa edildiği tarihtir. Cami muhtemelen aynı tarihte inşa edilmiş olmalıdır.

Cami boyuna dikdörtgen planlıdır. Önünde son cemaat yeri bulunmaktadır. Son cemaat yeri toplam altı adet ahşap direk üzerine ahşap kirişlemeli tavanla örtülüdür. Son cemaat yerinin doğu duvarları kapalıdır. Batı tarafında minare kaidesi yer almaktadır. Caminin 1982 yılında yapılan onarımından sonra son cemaat yerinin sol tarafına bir oda ilave edilmiştir. Son cemaat yerinin döşemesi taştır. Son cemaat yerinden basık kemerli kapı ile harim kısmına girilmektedir.

Harim, kıble duvarına paralel üç neflidir. Ortada yer alan ikişerden toplam dört adet sütun, birbirine ve doğu ile batı duvarına bitişik ayaklarına doğu–batı yönünde atılmış beşik kemerlerle bağlanmıştır. Sütun başlıkları devşirme malzemeden yapılmıştır. Sütunların taşıdığı kemerler ahşap kirişlemeli tavan taşımaktadır. Harim kuzey cephede iki, güney cephede iki, batı cephede üç, doğu cephede pencere ile aydınlanmaktadır. Doğu cephe pencereleri hariç diğerleri dikdörtgen kesitlidir. Doğu cephedeki pencereler içeriden dikdörtgen, dışarıdan yuvarlaktır. Mihrap kemerli basit niş şeklindedir. Ahşap minberin sanatsal özelliği bulunmamaktadır. İçeride toplam altı adet ahşap ayağın taşıdığı ahşap mahfil katı yer almaktadır. Minare çıkış kapısı mahfile açılmaktadır.

Duvarlar sıralı moloz taş duvar örgülüdür. Duvarların aralarına yatay olarak iki sıra halinde ahşap hatıl yerleştirilmiştir. Duvarlar sonradan yükseltilmiştir. Batı dış duvarına bitişik taş basamaklarla düz toprak dam örtülü çatıya çıkılmakta iken sonradan düz toprak dam üzerine ahşap çatı yapılmıştır. Duvarlar silme saçakla sonlanmaktadır. Ahşap çatı dıştan sac kaplıdır.

Minare son cemaat yerinin batısına bitişiktir ve taştandır. Kaidesi kare planlıdır. Kaideden silindirik gövdeye köşeleri pahlı pabuçlukla geçilmektedir. Şerefe altı üç sıra halinde iç ve dış bükey silmelerle oluşturulmuştur. Korkuluk kısmı taştandır. Külah taş kaplıdır.