19. yüzyılın ikinci yarısında ve özellikle 1877-78 Osmanlı Rus Savaşı’nın ardından Balkanlardan gelen göçmenlerin dini ihtiyaçları ve çocuklarının eğitimi adına devlet tarafından 1900-1905 yılların arasında Emlak-ı Humayun tarafından mektepli camiler inşa edilmiştir. Bölgedeki camilerin çoğunluğu tek tip proje üzerine müceddeden inşa edilen bu camilerdendir.

Naipyusuf Köyü Camii de aynı plan ve özelliklerde inşa edilmiştir.[1]

Kaynak:

[1] Edirne İli, Havsa İlçesi, Naipyusuf Köyü, 0/1553 Parselde Yer Alan Naipyusuf Camiinin; 1.Grup Korunması Gerekli Taşınmaz Kültür Varlığı Olarak Tescil Edilmesi ve Koruma Alanı Belirlenmesine İlişkin 23.05.2022 Tarih ve 8349 Sayılı Karar