Alaton köyü, 93 Harbi’nden (1877-1878) etkilenen Rumeli muhacirlerinin, o dönem (19.yy) iskana yasak olan Istranca Ormanları içine yerleşmesiyle oluşmuştur. Alaton’un ilk yerleşim yeri, Binkılıç Deresi havzasında bulunan, Koca Dere Mevkii üzerindedir. Binkılıç Deresi yerine yöresel bir isimlendirme olarak “Koca Dere” de kullanılmaktadır. Hatta, Binkılıç’taki dere kolu üzerine kurulan köprülerden birinin adı da “Koca Köprü”dür.

Derenin üstüne Koca Çeşme isminde bir çeşme kurulmuş ve bu çeşme civarına yerleşilmiştir. Köyün muhtarının ve imamının resmi mührünü 1887/1888 yıllarında göndermesiyle birlikte, köy oluşmuştur. Koca Dere ıslah çalışmaları öncesinde yalak olarak kullanılan çeşme, şimdilerdeyse bu fonksiyonunu kaybetmiştir.

Halk anlatılarına göre köyde yaşayan A.O.B., İshak Alaton’a mektup yazıp, Alaton köy adıyla kendisinin soy adının bir bağı olup olmadığını sormuştur. Dönemin köy muhtarı ve A.O.B., İshak Alaton’un daveti üzere, onunla görüşmüştür. Köyün isminin, Alaton ailesiyle bir bağı olmadığını öğrenmişlerdir. 2011 yılında, dönemin Çatalca Belediye Başkanı Cem Kara’nın tekrar iletişim kurduğu İshak Alaton, köyün tarihi çeşmesi olan Koca Çeşme’nin onarım masrafını karşılaşmıştır. Ağustos 2011 tarihinde, yenilenmiş çeşmenin açılışında İshak Alaton’u gururlandırmak için, çeşmenin taş yalağının üst kısmına bir plaka yerleştirilmiş ve şu yazılmıştır: “Bu çeşme, Sn. İshak Alaton’un Aydınlar (Alaton) Köyüne Hediyesidir, Ağustos 2011”.

Çeşmenin orijinal kitabesi yerinde değildir ve onarım geçmişi hakkında da bir bilgiye rastlanılamamaktadır.